La agricultura intensiva impacta la diversidad microbiana del suelo en Uruguay
Estos cambios pueden afectar procesos esenciales para el crecimiento vegetal, incluido el reciclaje microbiano del carbono, un proceso que ocurre cuando las bacterias y hongos del suelo mueren y sus restos se transforman en compuestos orgánicos que mejoran la captura y el almacenamiento de carbono en el suelo. En el contexto actual del cambio climático, comprender qué prácticas contribuyen a preservar esta capacidad es crucial, ya que no solo mejora la fertilidad del suelo, sino que también contribuye a reducir las emisiones de dióxido de carbono a la atmósfera.
Publicado en Environmental Microbiome , el estudio comparó suelos agrícolas con al menos una década de rotación de cultivos con pastizales nativos cercanos en condiciones climáticas y edáficas similares. Los suelos de pastizales nativos, que aún cubren alrededor del 50% del territorio uruguayo, albergan comunidades microbianas (bacterias, virus y hongos) que participan activamente en los ciclos del carbono, el nitrógeno y el fósforo, lo que los hace vitales tanto para la producción como para el medio ambiente.
Para comprender mejor el impacto de la agricultura en las comunidades microbianas del suelo, el equipo de investigación —parte de la tesis doctoral de Matías Giménez, investigador del Laboratorio de Genómica Microbiana del Instituto Pasteur de Montevideo— utilizó herramientas bioinformáticas para analizar un amplio conjunto de datos de secuencias genómicas. Esto les permitió no solo identificar los microorganismos presentes en el suelo, sino también determinar sus funciones dentro del ecosistema.
Los resultados mostraron que los suelos de pastizales albergan una mayor diversidad fúngica que los suelos agrícolas, probablemente relacionada con el uso intensivo de fungicidas. También se observó un aumento de hongos patógenos (causantes de enfermedades) y una disminución de hongos beneficiosos para las plantas.
En cuanto a las bacterias del suelo, si bien la diversidad general no disminuyó, se observaron cambios en su composición. Por ejemplo, se observó una disminución de géneros beneficiosos como Bacillus y Streptomyces , ambos conocidos por su papel en la fertilidad del suelo y la defensa de las plantas.
El estudio también detectó una menor presencia de bacteriófagos, virus que infectan a las bacterias y ayudan a regular sus poblaciones, a la vez que contribuyen a la liberación de nutrientes. Por lo tanto, su menor presencia podría afectar negativamente el reciclaje de carbono derivado de las bacterias.
Además, los suelos de pastizales mostraron una mayor riqueza y abundancia de genes y enzimas involucradas en el ciclo del nitrógeno y el fósforo.
Curiosamente, aunque los suelos agrícolas contenían niveles más altos de fósforo total, sus microbiomas eran menos eficientes a la hora de movilizar y reciclar este nutriente.
Según los autores, el estudio cobra especial importancia en el contexto de la rápida evolución del paisaje uruguayo. Entre 2001 y 2019, se perdieron casi un millón de hectáreas de pastizales, impulsada por la creciente demanda mundial de productos agrícolas.
Con base en esta nueva evidencia, los investigadores enfatizan la necesidad de adoptar prácticas agrícolas más sostenibles que preserven la biodiversidad microbiana y mejoren la resiliencia del suelo, ambos esenciales para la productividad a largo plazo y la mitigación de los impactos ambientales. El estudio ofrece nuevas perspectivas sobre cómo el uso del suelo afecta no solo a lo que crece sobre la superficie, sino también a los "aliados invisibles" que sustentan la salud del ecosistema desde el suelo.
Giménez, M., Berenstecher, P., Ligrone, A., Iraola, G. y Piñeiro, G. (2025). El análisis del microbioma del suelo de pastizales y cultivos uruguayos revela pérdidas de diversidad microbiana y características de reciclaje de la necromasa. Environ Microbiome , 20(1), 96. https://doi.org/10.1186/s40793-025-00696-4
(*) fuente: https://pasteur.uy/
